Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms