Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CCDC88CQ9P219 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCDC88CQ9P219 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCDC88CQ9P219 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCDC88CQ9P219 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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