Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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