Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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