Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms