Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms