Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms