Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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