Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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