Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms