Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms