Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms