Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms