Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms