Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSRNP1Q96S65 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms