Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms