Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms