Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms