Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms