Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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