Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms