Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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