Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms