Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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C9orf135Q5VTT2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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C9orf135Q5VTT2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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