Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms