Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms