Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms