Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms