Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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