Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms