Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms