Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NWD1Q149M9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NWD1Q149M9 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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