Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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