Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms