Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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APOFQ13790 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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APOFQ13790 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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APOFQ13790 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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