Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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