Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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