Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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