Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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TCIRG1Q13488 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TCIRG1Q13488 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TCIRG1Q13488 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TCIRG1Q13488 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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