Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms