Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SRSF6Q13247 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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SRSF6Q13247 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SRSF6Q13247 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF6Q13247 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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