Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms