Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP160Q12769 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP160Q12769 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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