Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms