Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms