Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms