Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FPGSQ05932 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms