Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms