Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms