Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms